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質量光度計在SARS-CoV-2方面的應用

點擊次數(shù):2055 更新時間:2024-03-30

應用案例(質量光度計):質量光度計在SARS-CoV-2方面的應用 

Mass Photometry on SARS-CoV-2           


翻譯整理:北京佰司特科技有限責任公司


質量光度法定量了溶液中生物分子的質量分布。它在分析低聚態(tài)和定量蛋白-蛋白相互作用方面的用途被用于研究突發(fā)性SARS-CoV-2病毒的刺突蛋白及其與ACE2受體的相互作用,這被認為是病毒進入人類細胞的主要途徑。

當前SARS-CoV-2大流行的出現(xiàn)引發(fā)了大量與冠狀病毒進入宿主細胞機制有關的功能和結構研究。刺突糖蛋白通過與人血管緊張素轉換酶2 (ACE2)緊密相互作用,形成從病毒表面突出的同源三聚體,作為刺突蛋白的功能受體。該蛋白隨后被宿主蛋白酶裂解,從而通過廣泛的不可逆構象變化激活該蛋白進行膜融合。

在這里,我們提出了一種基于質量光度法的分析方法,可以了解穗狀糖蛋白的寡聚態(tài)、與ACE2的相互作用以及直接與ACE2作用的受體結合域(RBD)的構象狀態(tài)的一些關鍵方面。這些rbd可以是“向上"構象,可以與ACE2相互作用,也可以是“向下"構象,不可能相互作用(圖1)。

我們可以證明重組產(chǎn)生SARS-CoV-2飆升ectodomain形式定義良好的三聚物(圖2)。在挑戰(zhàn)ACE2,可以識別不同的人口相對應綁定一個或多個副本ACE2每三聚物(圖2)這表明混合人口rbd的向上或向下的構象,以及ACE2與刺突蛋白內(nèi)可接近的rbd的功能結合。


1:SARS-CoV2棘突外結構域與ACE2復合物的結構,其中一個RBD位于“上"位置,兩個RBD位于“下"位置。將SARS-CoV2 spike (6VSB)的低溫電子顯微鏡結構疊加到與SARS-CoV2 RBD (6M17)配合物中的ACE2晶體結構上,建立了該模型。ACE2顯示為綠色。三聚體棘突蛋白顯示為具有結合能力的構象的RBD為粉紅色,n端結構域(NTD)為紫色,RBD為藍色。其他單體顯示為淺灰色和深灰色。


2:SARS-CoV-2棘突外域及其與ACE2相互作用的質譜特征。重組SARS-CoV-2棘突外結構域的質量直方圖(上面板),也顯示該蛋白三聚體形式的低溫電子顯微鏡結構的頂視圖。ACE2質量直方圖(下圖)。該插圖顯示,SARS-CoV-2棘突外結構域可以結合多個ACE2副本,表明在一個三聚體中,幾個rbd可以處于能夠勝任結合的位置。

當前SARS-CoV-2大流行的出現(xiàn)引發(fā)了大量與冠狀病毒進入宿主細胞機制有關的功能和結構研究。刺突糖蛋白通過與人血管緊張素轉換酶2 (ACE2)緊密相互作用,形成從病毒表面突出的同源三聚體,作為刺突蛋白的功能受體。該蛋白隨后被宿主蛋白酶裂解,從而通過廣泛的不可逆構象變化激活該蛋白進行膜融合。

在這里,我們提出了一種基于質量光度法的分析方法,可以了解穗狀糖蛋白的寡聚態(tài)、與ACE2的相互作用以及直接與ACE2作用的受體結合域(RBD)的構象狀態(tài)的一些關鍵方面。這些rbd可以是“向上"構象,可以與ACE2相互作用,也可以是“向下"構象,不可能相互作用(圖1)。

我們可以證明重組產(chǎn)生SARS-CoV-2飆升ectodomain形式定義良好的三聚物(圖2)。在挑戰(zhàn)ACE2,可以識別不同的人口相對應綁定一個或多個副本ACE2每三聚物(圖2)這表明混合人口rbd的向上或向下的構象,以及ACE2與刺突蛋白內(nèi)可接近的rbd的功能結合。

在這里,我們介紹了使用質量光度法研究SARS-CoV-2刺突蛋白結合ACE2受體的機制。我們可以進一步擴展這項實驗,以監(jiān)測抗體如何與刺突蛋白三聚體結合,并最終破壞與ACE2的相互作用。


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